MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 plasmid pAS9A-2

Total Repeats: 2012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015561	GTT	2	6	40	45	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917558
2	NC_015561	AGT	2	6	54	59	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917558
3	NC_015561	CAA	2	6	127	132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917558
4	NC_015561	GCA	2	6	190	195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917558
5	NC_015561	GA	3	6	320	325	50 %	0 %	50 %	0 %	333917558
6	NC_015561	CGA	2	6	361	366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917558
7	NC_015561	GCA	3	9	409	417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917558
8	NC_015561	CGGG	2	8	526	533	0 %	0 %	75 %	25 %	333917558
9	NC_015561	CGC	2	6	570	575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917558
10	NC_015561	TCA	2	6	708	713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917558
11	NC_015561	GTA	2	6	875	880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917558
12	NC_015561	GCG	2	6	881	886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917558
13	NC_015561	CGAT	2	8	912	919	25 %	25 %	25 %	25 %	333917558
14	NC_015561	GGC	2	6	1041	1046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917558
15	NC_015561	GCC	2	6	1122	1127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917558
16	NC_015561	ATT	2	6	1279	1284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333917559
17	NC_015561	GCA	2	6	1306	1311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917559
18	NC_015561	GCA	2	6	1370	1375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917559
19	NC_015561	GC	3	6	1443	1448	0 %	0 %	50 %	50 %	333917559
20	NC_015561	CT	3	6	1605	1610	0 %	50 %	0 %	50 %	333917560
21	NC_015561	AG	3	6	1614	1619	50 %	0 %	50 %	0 %	333917560
22	NC_015561	CAT	2	6	1634	1639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917560
23	NC_015561	TGG	2	6	1721	1726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917561
24	NC_015561	GCCGTT	2	12	1777	1788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917561
25	NC_015561	CGC	2	6	1837	1842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917561
26	NC_015561	CTC	2	6	1882	1887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917561
27	NC_015561	GCTGG	2	10	1971	1980	0 %	20 %	60 %	20 %	333917561
28	NC_015561	TCT	2	6	2047	2052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917561
29	NC_015561	GTG	2	6	2053	2058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917561
30	NC_015561	GCT	2	6	2092	2097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917561
31	NC_015561	GCG	2	6	2203	2208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917561
32	NC_015561	GGCA	2	8	2342	2349	25 %	0 %	50 %	25 %	333917562
33	NC_015561	AAGG	2	8	2387	2394	50 %	0 %	50 %	0 %	333917562
34	NC_015561	CCGGAC	2	12	2407	2418	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333917562
35	NC_015561	ATT	2	6	2483	2488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333917562
36	NC_015561	GCC	3	9	2489	2497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917562
37	NC_015561	AGC	2	6	2508	2513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917562
38	NC_015561	GTG	2	6	2606	2611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917563
39	NC_015561	GAA	2	6	2668	2673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917563
40	NC_015561	TGA	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917563
41	NC_015561	GAAC	2	8	2738	2745	50 %	0 %	25 %	25 %	333917563
42	NC_015561	CTG	2	6	2762	2767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917563
43	NC_015561	GT	3	6	2816	2821	0 %	50 %	50 %	0 %	333917563
44	NC_015561	CGG	2	6	2876	2881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917563
45	NC_015561	CCG	2	6	2905	2910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917563
46	NC_015561	CGG	2	6	2911	2916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917563
47	NC_015561	CTG	2	6	2929	2934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917563
48	NC_015561	CAG	2	6	2947	2952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917563
49	NC_015561	AAT	2	6	2957	2962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333917563
50	NC_015561	CAA	2	6	3538	3543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917564
51	NC_015561	CAC	2	6	3555	3560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917564
52	NC_015561	TCG	2	6	3567	3572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917564
53	NC_015561	GCC	2	6	3575	3580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917564
54	NC_015561	GGT	2	6	3618	3623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917564
55	NC_015561	CCA	2	6	3691	3696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917565
56	NC_015561	CG	3	6	3758	3763	0 %	0 %	50 %	50 %	333917565
57	NC_015561	ATG	2	6	3810	3815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917565
58	NC_015561	CTC	2	6	3816	3821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917565
59	NC_015561	TCG	2	6	3856	3861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917565
60	NC_015561	CGG	2	6	3968	3973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917565
61	NC_015561	GCT	2	6	4236	4241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917566
62	NC_015561	TGG	2	6	4249	4254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917566
63	NC_015561	GCA	2	6	4266	4271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917566
64	NC_015561	ACA	2	6	4293	4298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917566
65	NC_015561	ACA	2	6	4320	4325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917566
66	NC_015561	AGCC	2	8	4402	4409	25 %	0 %	25 %	50 %	333917566
67	NC_015561	GCA	2	6	4429	4434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917566
68	NC_015561	CG	3	6	4492	4497	0 %	0 %	50 %	50 %	333917566
69	NC_015561	CAC	2	6	4498	4503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917566
70	NC_015561	GAA	2	6	4545	4550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917566
71	NC_015561	CAG	2	6	4588	4593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917566
72	NC_015561	AAG	2	6	4594	4599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917566
73	NC_015561	C	6	6	4602	4607	0 %	0 %	0 %	100 %	333917566
74	NC_015561	AGCC	2	8	4662	4669	25 %	0 %	25 %	50 %	333917566
75	NC_015561	GCTCA	2	10	4678	4687	20 %	20 %	20 %	40 %	333917566
76	NC_015561	GCCT	2	8	4690	4697	0 %	25 %	25 %	50 %	333917566
77	NC_015561	CAC	2	6	4711	4716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917566
78	NC_015561	GAA	2	6	4755	4760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917566
79	NC_015561	GCG	2	6	4837	4842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917566
80	NC_015561	GGC	2	6	4869	4874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917566
81	NC_015561	CGGA	2	8	4921	4928	25 %	0 %	50 %	25 %	333917566
82	NC_015561	CAC	2	6	4976	4981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917566
83	NC_015561	CAG	2	6	5062	5067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917566
84	NC_015561	CCAG	2	8	5132	5139	25 %	0 %	25 %	50 %	333917566
85	NC_015561	CGG	2	6	5156	5161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917566
86	NC_015561	CGG	2	6	5189	5194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917566
87	NC_015561	ACC	2	6	5220	5225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917566
88	NC_015561	ACA	2	6	5242	5247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917566
89	NC_015561	ACA	2	6	5260	5265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917566
90	NC_015561	CG	3	6	5308	5313	0 %	0 %	50 %	50 %	333917566
91	NC_015561	CAG	2	6	5398	5403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917566
92	NC_015561	TGG	2	6	5451	5456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917566
93	NC_015561	CTG	2	6	5458	5463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917566
94	NC_015561	TG	3	6	5501	5506	0 %	50 %	50 %	0 %	333917566
95	NC_015561	C	6	6	5563	5568	0 %	0 %	0 %	100 %	333917566
96	NC_015561	ACG	2	6	5593	5598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917566
97	NC_015561	CAA	2	6	5726	5731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917566
98	NC_015561	AACA	2	8	5737	5744	75 %	0 %	0 %	25 %	333917566
99	NC_015561	ACA	2	6	5747	5752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917566
100	NC_015561	CCA	2	6	5766	5771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917566
101	NC_015561	CAT	2	6	5826	5831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917566
102	NC_015561	TAC	2	6	5865	5870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917566
103	NC_015561	ACC	2	6	5917	5922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917566
104	NC_015561	CA	4	8	6023	6030	50 %	0 %	0 %	50 %	333917566
105	NC_015561	AGG	2	6	6067	6072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917566
106	NC_015561	ACG	2	6	6077	6082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917566
107	NC_015561	GGT	2	6	6083	6088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917566
108	NC_015561	GGT	2	6	6155	6160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917566
109	NC_015561	GCG	3	9	6172	6180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917566
110	NC_015561	TGGC	2	8	6193	6200	0 %	25 %	50 %	25 %	333917566
111	NC_015561	CTC	2	6	6234	6239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917566
112	NC_015561	CAA	2	6	6244	6249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917566
113	NC_015561	TGA	2	6	6488	6493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917567
114	NC_015561	TTA	2	6	6510	6515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333917567
115	NC_015561	TCA	2	6	6524	6529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917567
116	NC_015561	CGC	2	6	6558	6563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917567
117	NC_015561	CTT	2	6	7427	7432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917568
118	NC_015561	T	7	7	8395	8401	0 %	100 %	0 %	0 %	333917569
119	NC_015561	GT	3	6	8417	8422	0 %	50 %	50 %	0 %	333917569
120	NC_015561	GGC	2	6	8492	8497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917569
121	NC_015561	GGGACG	2	12	8558	8569	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	333917569
122	NC_015561	CAGC	2	8	8587	8594	25 %	0 %	25 %	50 %	333917569
123	NC_015561	GCGAGG	2	12	8613	8624	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	333917569
124	NC_015561	GAA	2	6	8683	8688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917569
125	NC_015561	CGG	2	6	8692	8697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917569
126	NC_015561	GATC	2	8	8704	8711	25 %	25 %	25 %	25 %	333917569
127	NC_015561	GCG	2	6	8712	8717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917569
128	NC_015561	GAT	2	6	8750	8755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917569
129	NC_015561	GGT	2	6	8763	8768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917569
130	NC_015561	CCG	2	6	8811	8816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917569
131	NC_015561	GC	3	6	8872	8877	0 %	0 %	50 %	50 %	333917569
132	NC_015561	GGT	2	6	8917	8922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917569
133	NC_015561	ATC	2	6	8985	8990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917569
134	NC_015561	CCTG	2	8	8998	9005	0 %	25 %	25 %	50 %	333917570
135	NC_015561	C	6	6	9034	9039	0 %	0 %	0 %	100 %	333917570
136	NC_015561	GTG	2	6	9040	9045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917570
137	NC_015561	CCG	2	6	9068	9073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917570
138	NC_015561	GCC	2	6	9118	9123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917570
139	NC_015561	ATG	2	6	9161	9166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917570
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142	NC_015561	GTG	2	6	9391	9396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917570
143	NC_015561	TGA	2	6	9462	9467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917570
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148	NC_015561	GCG	2	6	9647	9652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917570
149	NC_015561	CGG	2	6	9656	9661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917570
150	NC_015561	CGG	2	6	9744	9749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917570
151	NC_015561	TG	3	6	9788	9793	0 %	50 %	50 %	0 %	333917570
152	NC_015561	CGCC	2	8	9816	9823	0 %	0 %	25 %	75 %	333917570
153	NC_015561	ATC	2	6	9854	9859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917570
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156	NC_015561	ATC	2	6	9968	9973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917570
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165	NC_015561	GGTG	2	8	10243	10250	0 %	25 %	75 %	0 %	333917570
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168	NC_015561	TCT	2	6	10653	10658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917571
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250	NC_015561	ATC	2	6	14260	14265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917574
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253	NC_015561	TACA	2	8	14793	14800	50 %	25 %	0 %	25 %	333917576
254	NC_015561	CAC	2	6	14865	14870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917576
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257	NC_015561	CAA	2	6	15047	15052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917576
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262	NC_015561	TGG	2	6	15483	15488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917576
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388	NC_015561	TGC	2	6	22925	22930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917586
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497	NC_015561	GCC	3	9	31307	31315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917597
498	NC_015561	TCGC	2	8	31470	31477	0 %	25 %	25 %	50 %	333917597
499	NC_015561	GCG	2	6	31512	31517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917597
500	NC_015561	GGC	2	6	31531	31536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917597

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